Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM9Q9C026 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM9Q9C026 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms