Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PLVAPQ9BX97 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLVAPQ9BX97 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLVAPQ9BX97 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLVAPQ9BX97 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms