Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP58Q9BVL2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP58Q9BVL2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms