Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms