Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ARXQ96QS3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARXQ96QS3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARXQ96QS3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms