Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q40

CDK15, Cyclin-dependent kinase 15, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK15Q96Q40 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK15Q96Q40 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK15Q96Q40 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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