Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMO7Q8WWI1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms