Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDN7

ACER1, Alkaline ceramidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER1Q8TDN7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACER1Q8TDN7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACER1Q8TDN7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms