Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms