Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LDLRAD1Q5T700 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LDLRAD1Q5T700 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LDLRAD1Q5T700 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LDLRAD1Q5T700 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LDLRAD1Q5T700 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms