Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.6 ms