Protein–RNA interactions for Protein: Q5PT55

SLC10A5, Sodium/bile acid cotransporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A5Q5PT55 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC10A5Q5PT55 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC10A5Q5PT55 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC10A5Q5PT55 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC10A5Q5PT55 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
SLC10A5Q5PT55 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC10A5Q5PT55 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms