Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP41Q3LFD5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP41Q3LFD5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms