Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIL3Q16649 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFIL3Q16649 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
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