Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYPL1Q16563 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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