Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSRP2Q16527 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSRP2Q16527 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms