Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA1EQ15878 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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