Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CHRNA2Q15822 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CHRNA2Q15822 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CHRNA2Q15822 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHRNA2Q15822 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHRNA2Q15822 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHRNA2Q15822 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHRNA2Q15822 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHRNA2Q15822 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHRNA2Q15822 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHRNA2Q15822 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHRNA2Q15822 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHRNA2Q15822 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHRNA2Q15822 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHRNA2Q15822 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHRNA2Q15822 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHRNA2Q15822 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHRNA2Q15822 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHRNA2Q15822 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHRNA2Q15822 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHRNA2Q15822 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHRNA2Q15822 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHRNA2Q15822 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHRNA2Q15822 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHRNA2Q15822 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHRNA2Q15822 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHRNA2Q15822 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHRNA2Q15822 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms