Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PICALMQ13492 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PICALMQ13492 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
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