Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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GTF3C1Q12789 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C1Q12789 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C1Q12789 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C1Q12789 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C1Q12789 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C1Q12789 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C1Q12789 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C1Q12789 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C1Q12789 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C1Q12789 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C1Q12789 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C1Q12789 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
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GTF3C1Q12789 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C1Q12789 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C1Q12789 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C1Q12789 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C1Q12789 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
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GTF3C1Q12789 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C1Q12789 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF3C1Q12789 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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GTF3C1Q12789 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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GTF3C1Q12789 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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GTF3C1Q12789 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C1Q12789 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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GTF3C1Q12789 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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GTF3C1Q12789 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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