Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 YPL199CYPL199C 723 nt4.15□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 CBP3YPL215W 1008 nt4.15□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 CSH1YBR161W 1131 nt4.15□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 ZPR1YGR211W 1461 nt4.15□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 EAR1YMR171C 1653 nt4.15□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 RAD30YDR419W 1899 nt4.15□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 PAH1YMR165C 2589 nt4.14□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 SER33YIL074C 1410 nt4.14□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 NOP8YOL144W 1455 nt4.14□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt4.14□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 SEC28YIL076W 891 nt4.14□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 ECM15YBL001C 315 nt4.14□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 POP8YBL018C 402 nt4.14□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 SLZ1YNL196C 897 nt4.14□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt4.14□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 OLE1YGL055W 1533 nt4.14□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt4.14□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt4.14□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 PDR15YDR406W 4590 nt4.14□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 KGD1YIL125W 3045 nt4.13□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 STB2YMR053C 2553 nt4.13□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 YCR101CYCR101C 549 nt4.13□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 CTH1YDR151C 978 nt4.13□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 JAC1YGL018C 555 nt4.13□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 RSM26YJR101W 801 nt4.13□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 YAL069WYAL069W 315 nt4.13□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 YLR125WYLR125W 411 nt4.13□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 YLR365WYLR365W 333 nt4.13□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 YMR315WYMR315W 1050 nt4.13□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 YNL217WYNL217W 981 nt4.13□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 CPR8YNR028W 927 nt4.13□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 YOL118CYOL118C 309 nt4.13□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 MRM1YOR201C 1239 nt4.13□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 FEX1YOR390W 1128 nt4.13□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 YPL114WYPL114W 420 nt4.13□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 FEX2YPL279C 1128 nt4.13□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 SLM4YBR077C 489 nt4.13□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt4.13□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt4.13□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 MET4YNL103W 2019 nt4.12□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 KIN28YDL108W 921 nt4.12□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 MPS2YGL075C 1164 nt4.12□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 ARC1YGL105W 1131 nt4.12□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 ARO2YGL148W 1131 nt4.12□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 GAB1YLR459W 1185 nt4.12□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 EAF7YNL136W 1278 nt4.12□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 POP4YBR257W 840 nt4.12□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 ALG11YNL048W 1647 nt4.12□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 APC4YDR118W 1959 nt4.12□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 RTK1YDL025C 1863 nt4.11□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 KTR7YIL085C 1554 nt4.11□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 ECM32YER176W 3366 nt4.11□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt4.11□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 YDL012CYDL012C 324 nt4.11□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 DAS2YDR020C 699 nt4.11□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 ENT5YDR153C 1236 nt4.11□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 YGR283CYGR283C 1026 nt4.11□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt4.11□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 YJR071WYJR071W 369 nt4.11□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 YAL064WYAL064W 285 nt4.11□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 NSE1YLR007W 1011 nt4.11□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 GCD7YLR291C 1146 nt4.11□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 YLR366WYLR366W 306 nt4.11□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 YML119WYML119W 1074 nt4.11□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 YMR010WYMR010W 1218 nt4.11□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 YNL171CYNL171C 369 nt4.11□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 YNL296WYNL296W 315 nt4.11□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 YBR016WYBR016W 387 nt4.11□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 BMT2YBR141C 1014 nt4.11□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 SLX1YBR228W 915 nt4.11□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 COT1YOR316C 1320 nt4.11□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 GPB1YOR371C 2694 nt4.11□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 GEP7YGL057C 864 nt4.1□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 ATG33YLR356W 594 nt4.1□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 IZH4YOL101C 939 nt4.1□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 CYC2YOR037W 1101 nt4.1□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 ECM8YBR076W 1065 nt4.1□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 DBP5YOR046C 1449 nt4.1□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 snR7-SsnR7-S 179 nt4.09□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 NUS1YDL193W 1128 nt4.09□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 COQ4YDR204W 1008 nt4.09□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 BMH1YER177W 804 nt4.09□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt4.09□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 USB1YLR132C 873 nt4.09□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 WRS1YOL097C 1299 nt4.09□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 YOR314WYOR314W 330 nt4.09□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 MRP2YPR166C 348 nt4.09□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 SKG6YHR149C 2205 nt4.09□□□□□ -1.76
SSK1Q07084 BBC1YJL020C 3474 nt4.08□□□□□ -1.76
SSK1Q07084 YDL158CYDL158C 309 nt4.08□□□□□ -1.76
SSK1Q07084 STB3YDR169C 1542 nt4.08□□□□□ -1.76
SSK1Q07084 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt4.08□□□□□ -1.76
SSK1Q07084 PMC1YGL006W 3522 nt4.08□□□□□ -1.76
SSK1Q07084 KIC1YHR102W 3243 nt4.08□□□□□ -1.76
SSK1Q07084 YIL025CYIL025C 375 nt4.08□□□□□ -1.76
SSK1Q07084 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt4.08□□□□□ -1.76
SSK1Q07084 GSM1YJL103C 1857 nt4.08□□□□□ -1.76
SSK1Q07084 AVT1YJR001W 1809 nt4.08□□□□□ -1.76
SSK1Q07084 SOF1YLL011W 1470 nt4.08□□□□□ -1.76
SSK1Q07084 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt4.08□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.8 ms