Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT17Q04695 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms