Protein–RNA interactions for Protein: P78560

CRADD, Death domain-containing protein CRADD, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRADDP78560 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRADDP78560 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRADDP78560 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRADDP78560 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRADDP78560 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRADDP78560 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRADDP78560 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRADDP78560 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRADDP78560 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRADDP78560 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRADDP78560 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRADDP78560 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CRADDP78560 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRADDP78560 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CRADDP78560 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRADDP78560 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRADDP78560 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRADDP78560 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRADDP78560 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRADDP78560 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRADDP78560 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRADDP78560 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRADDP78560 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRADDP78560 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRADDP78560 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRADDP78560 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRADDP78560 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRADDP78560 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRADDP78560 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRADDP78560 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRADDP78560 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRADDP78560 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRADDP78560 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRADDP78560 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CRADDP78560 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CRADDP78560 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CRADDP78560 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CRADDP78560 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRADDP78560 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRADDP78560 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRADDP78560 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRADDP78560 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRADDP78560 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRADDP78560 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRADDP78560 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRADDP78560 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRADDP78560 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRADDP78560 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRADDP78560 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRADDP78560 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRADDP78560 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CRADDP78560 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRADDP78560 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CRADDP78560 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRADDP78560 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRADDP78560 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRADDP78560 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRADDP78560 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRADDP78560 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRADDP78560 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRADDP78560 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRADDP78560 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRADDP78560 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRADDP78560 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRADDP78560 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRADDP78560 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CRADDP78560 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRADDP78560 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRADDP78560 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRADDP78560 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRADDP78560 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRADDP78560 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRADDP78560 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRADDP78560 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRADDP78560 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRADDP78560 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRADDP78560 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRADDP78560 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRADDP78560 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRADDP78560 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRADDP78560 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRADDP78560 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRADDP78560 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRADDP78560 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRADDP78560 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRADDP78560 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRADDP78560 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRADDP78560 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRADDP78560 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRADDP78560 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRADDP78560 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRADDP78560 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRADDP78560 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRADDP78560 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRADDP78560 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRADDP78560 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRADDP78560 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRADDP78560 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CRADDP78560 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRADDP78560 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms