Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTG2P63267 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTG2P63267 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms