Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTA2P62736 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTA2P62736 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms