Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PIP4K2AP48426 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms