Protein–RNA interactions for Protein: P48066

SLC6A11, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A11P48066 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A11P48066 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms