Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX1P40424 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX1P40424 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX1P40424 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX1P40424 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX1P40424 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX1P40424 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX1P40424 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX1P40424 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX1P40424 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX1P40424 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX1P40424 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX1P40424 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX1P40424 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX1P40424 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PBX1P40424 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBX1P40424 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBX1P40424 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBX1P40424 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBX1P40424 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBX1P40424 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PBX1P40424 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBX1P40424 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBX1P40424 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBX1P40424 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBX1P40424 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBX1P40424 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBX1P40424 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBX1P40424 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBX1P40424 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBX1P40424 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBX1P40424 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBX1P40424 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBX1P40424 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBX1P40424 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PBX1P40424 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PBX1P40424 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PBX1P40424 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PBX1P40424 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PBX1P40424 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PBX1P40424 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PBX1P40424 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PBX1P40424 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PBX1P40424 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PBX1P40424 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PBX1P40424 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PBX1P40424 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PBX1P40424 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PBX1P40424 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PBX1P40424 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX1P40424 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX1P40424 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX1P40424 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX1P40424 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX1P40424 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX1P40424 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX1P40424 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX1P40424 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX1P40424 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX1P40424 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX1P40424 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PBX1P40424 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBX1P40424 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBX1P40424 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBX1P40424 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBX1P40424 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBX1P40424 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PBX1P40424 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBX1P40424 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBX1P40424 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBX1P40424 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBX1P40424 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBX1P40424 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PBX1P40424 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PBX1P40424 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PBX1P40424 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PBX1P40424 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PBX1P40424 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PBX1P40424 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PBX1P40424 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PBX1P40424 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PBX1P40424 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PBX1P40424 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PBX1P40424 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PBX1P40424 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PBX1P40424 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PBX1P40424 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PBX1P40424 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PBX1P40424 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PBX1P40424 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PBX1P40424 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PBX1P40424 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PBX1P40424 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PBX1P40424 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PBX1P40424 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PBX1P40424 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PBX1P40424 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PBX1P40424 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PBX1P40424 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PBX1P40424 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms