Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCND3P30281 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCND3P30281 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCND3P30281 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCND3P30281 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCND3P30281 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCND3P30281 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCND3P30281 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCND3P30281 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCND3P30281 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCND3P30281 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCND3P30281 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCND3P30281 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCND3P30281 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCND3P30281 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCND3P30281 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCND3P30281 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCND3P30281 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCND3P30281 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCND3P30281 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCND3P30281 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCND3P30281 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCND3P30281 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCND3P30281 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCND3P30281 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCND3P30281 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCND3P30281 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCND3P30281 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCND3P30281 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCND3P30281 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCND3P30281 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCND3P30281 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCND3P30281 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCND3P30281 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCND3P30281 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCND3P30281 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCND3P30281 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCND3P30281 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCND3P30281 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCND3P30281 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCND3P30281 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCND3P30281 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCND3P30281 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCND3P30281 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCND3P30281 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCND3P30281 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCND3P30281 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCND3P30281 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCND3P30281 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCND3P30281 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCND3P30281 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCND3P30281 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCND3P30281 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCND3P30281 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCND3P30281 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCND3P30281 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCND3P30281 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCND3P30281 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCND3P30281 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCND3P30281 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCND3P30281 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCND3P30281 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCND3P30281 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCND3P30281 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCND3P30281 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCND3P30281 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCND3P30281 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCND3P30281 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCND3P30281 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCND3P30281 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCND3P30281 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCND3P30281 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCND3P30281 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCND3P30281 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCND3P30281 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCND3P30281 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCND3P30281 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCND3P30281 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCND3P30281 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCND3P30281 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCND3P30281 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCND3P30281 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCND3P30281 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCND3P30281 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCND3P30281 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCND3P30281 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCND3P30281 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCND3P30281 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCND3P30281 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCND3P30281 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCND3P30281 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCND3P30281 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCND3P30281 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCND3P30281 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCND3P30281 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCND3P30281 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCND3P30281 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCND3P30281 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCND3P30281 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCND3P30281 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms