Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP1P29466 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP1P29466 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP1P29466 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP1P29466 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP1P29466 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP1P29466 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP1P29466 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP1P29466 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP1P29466 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP1P29466 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP1P29466 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP1P29466 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP1P29466 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP1P29466 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP1P29466 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP1P29466 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP1P29466 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP1P29466 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP1P29466 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP1P29466 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP1P29466 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP1P29466 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP1P29466 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP1P29466 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP1P29466 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP1P29466 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP1P29466 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP1P29466 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP1P29466 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP1P29466 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP1P29466 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP1P29466 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP1P29466 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP1P29466 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP1P29466 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP1P29466 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP1P29466 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP1P29466 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP1P29466 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP1P29466 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP1P29466 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP1P29466 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP1P29466 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP1P29466 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP1P29466 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP1P29466 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP1P29466 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP1P29466 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP1P29466 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP1P29466 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP1P29466 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP1P29466 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP1P29466 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP1P29466 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP1P29466 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP1P29466 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP1P29466 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP1P29466 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP1P29466 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP1P29466 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP1P29466 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP1P29466 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP1P29466 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP1P29466 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP1P29466 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP1P29466 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP1P29466 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP1P29466 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP1P29466 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASP1P29466 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASP1P29466 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASP1P29466 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASP1P29466 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASP1P29466 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASP1P29466 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASP1P29466 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASP1P29466 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP1P29466 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP1P29466 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP1P29466 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP1P29466 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP1P29466 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP1P29466 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP1P29466 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP1P29466 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP1P29466 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP1P29466 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP1P29466 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP1P29466 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP1P29466 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP1P29466 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP1P29466 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP1P29466 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP1P29466 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP1P29466 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP1P29466 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP1P29466 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP1P29466 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP1P29466 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms