Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTGFP29279 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTGFP29279 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTGFP29279 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTGFP29279 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTGFP29279 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTGFP29279 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTGFP29279 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTGFP29279 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTGFP29279 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTGFP29279 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CTGFP29279 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTGFP29279 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTGFP29279 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTGFP29279 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTGFP29279 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTGFP29279 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTGFP29279 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTGFP29279 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CTGFP29279 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTGFP29279 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTGFP29279 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CTGFP29279 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTGFP29279 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTGFP29279 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTGFP29279 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTGFP29279 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTGFP29279 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTGFP29279 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTGFP29279 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTGFP29279 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTGFP29279 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTGFP29279 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTGFP29279 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTGFP29279 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTGFP29279 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTGFP29279 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTGFP29279 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTGFP29279 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTGFP29279 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTGFP29279 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTGFP29279 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTGFP29279 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTGFP29279 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTGFP29279 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTGFP29279 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTGFP29279 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTGFP29279 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTGFP29279 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CTGFP29279 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTGFP29279 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTGFP29279 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CTGFP29279 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTGFP29279 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTGFP29279 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTGFP29279 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTGFP29279 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTGFP29279 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTGFP29279 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTGFP29279 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTGFP29279 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTGFP29279 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CTGFP29279 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CTGFP29279 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTGFP29279 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTGFP29279 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTGFP29279 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTGFP29279 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTGFP29279 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTGFP29279 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTGFP29279 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTGFP29279 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTGFP29279 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CTGFP29279 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTGFP29279 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTGFP29279 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTGFP29279 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTGFP29279 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTGFP29279 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTGFP29279 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTGFP29279 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTGFP29279 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CTGFP29279 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTGFP29279 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CTGFP29279 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTGFP29279 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTGFP29279 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTGFP29279 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTGFP29279 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTGFP29279 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTGFP29279 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTGFP29279 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTGFP29279 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTGFP29279 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTGFP29279 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTGFP29279 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTGFP29279 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTGFP29279 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTGFP29279 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTGFP29279 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms