Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms