Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA1P17302 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJA1P17302 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJA1P17302 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJA1P17302 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJA1P17302 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJA1P17302 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJA1P17302 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJA1P17302 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJA1P17302 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJA1P17302 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJA1P17302 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJA1P17302 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJA1P17302 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJA1P17302 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJA1P17302 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJA1P17302 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJA1P17302 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJA1P17302 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJA1P17302 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GJA1P17302 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJA1P17302 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJA1P17302 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJA1P17302 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJA1P17302 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA1P17302 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA1P17302 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA1P17302 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA1P17302 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA1P17302 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA1P17302 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA1P17302 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA1P17302 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA1P17302 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA1P17302 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA1P17302 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA1P17302 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA1P17302 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA1P17302 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA1P17302 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA1P17302 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA1P17302 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA1P17302 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA1P17302 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA1P17302 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA1P17302 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA1P17302 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA1P17302 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA1P17302 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA1P17302 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA1P17302 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA1P17302 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA1P17302 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA1P17302 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA1P17302 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA1P17302 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA1P17302 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA1P17302 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA1P17302 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA1P17302 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA1P17302 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA1P17302 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA1P17302 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA1P17302 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA1P17302 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA1P17302 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA1P17302 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA1P17302 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA1P17302 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA1P17302 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA1P17302 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA1P17302 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA1P17302 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA1P17302 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA1P17302 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA1P17302 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA1P17302 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA1P17302 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA1P17302 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA1P17302 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJA1P17302 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GJA1P17302 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GJA1P17302 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJA1P17302 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJA1P17302 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJA1P17302 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJA1P17302 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJA1P17302 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJA1P17302 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJA1P17302 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA1P17302 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA1P17302 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA1P17302 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA1P17302 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA1P17302 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA1P17302 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA1P17302 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA1P17302 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA1P17302 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA1P17302 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms