Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM17P0DL12 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM17P0DL12 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms