Protein–RNA interactions for Protein: P0CG20

PRR35, Proline-rich protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR35P0CG20 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRR35P0CG20 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRR35P0CG20 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms