Protein–RNA interactions for Protein: P07903

Ercc1, DNA excision repair protein ERCC-1, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc1P07903 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc1P07903 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc1P07903 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc1P07903 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc1P07903 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc1P07903 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc1P07903 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc1P07903 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc1P07903 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc1P07903 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc1P07903 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc1P07903 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc1P07903 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc1P07903 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc1P07903 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc1P07903 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc1P07903 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc1P07903 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc1P07903 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc1P07903 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc1P07903 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ercc1P07903 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc1P07903 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms