Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IGKV1-17P01599 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms