Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIOO75962 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIOO75962 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIOO75962 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIOO75962 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIOO75962 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIOO75962 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIOO75962 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIOO75962 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIOO75962 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIOO75962 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIOO75962 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIOO75962 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIOO75962 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIOO75962 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIOO75962 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIOO75962 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIOO75962 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIOO75962 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIOO75962 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIOO75962 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIOO75962 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIOO75962 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIOO75962 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIOO75962 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIOO75962 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIOO75962 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIOO75962 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIOO75962 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIOO75962 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIOO75962 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIOO75962 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIOO75962 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIOO75962 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIOO75962 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOO75962 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOO75962 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOO75962 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOO75962 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOO75962 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOO75962 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOO75962 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOO75962 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOO75962 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOO75962 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOO75962 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOO75962 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOO75962 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOO75962 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOO75962 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOO75962 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOO75962 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOO75962 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOO75962 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOO75962 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIOO75962 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIOO75962 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIOO75962 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIOO75962 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIOO75962 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIOO75962 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIOO75962 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIOO75962 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOO75962 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOO75962 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOO75962 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOO75962 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOO75962 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOO75962 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOO75962 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOO75962 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOO75962 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOO75962 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOO75962 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOO75962 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOO75962 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOO75962 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOO75962 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOO75962 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOO75962 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOO75962 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOO75962 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOO75962 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOO75962 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOO75962 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOO75962 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOO75962 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOO75962 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOO75962 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOO75962 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOO75962 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOO75962 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOO75962 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIOO75962 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIOO75962 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIOO75962 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIOO75962 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIOO75962 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIOO75962 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIOO75962 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms