Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GNPATO15228 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GNPATO15228 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GNPATO15228 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GNPATO15228 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GNPATO15228 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GNPATO15228 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GNPATO15228 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GNPATO15228 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GNPATO15228 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GNPATO15228 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GNPATO15228 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GNPATO15228 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GNPATO15228 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GNPATO15228 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GNPATO15228 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GNPATO15228 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GNPATO15228 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GNPATO15228 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GNPATO15228 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GNPATO15228 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GNPATO15228 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GNPATO15228 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GNPATO15228 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GNPATO15228 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GNPATO15228 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GNPATO15228 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GNPATO15228 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GNPATO15228 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GNPATO15228 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GNPATO15228 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GNPATO15228 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GNPATO15228 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GNPATO15228 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GNPATO15228 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GNPATO15228 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GNPATO15228 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GNPATO15228 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
GNPATO15228 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GNPATO15228 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GNPATO15228 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GNPATO15228 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GNPATO15228 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GNPATO15228 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GNPATO15228 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GNPATO15228 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GNPATO15228 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GNPATO15228 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GNPATO15228 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GNPATO15228 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GNPATO15228 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GNPATO15228 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GNPATO15228 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GNPATO15228 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GNPATO15228 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GNPATO15228 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GNPATO15228 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GNPATO15228 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GNPATO15228 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GNPATO15228 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GNPATO15228 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GNPATO15228 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GNPATO15228 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GNPATO15228 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GNPATO15228 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GNPATO15228 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GNPATO15228 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GNPATO15228 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GNPATO15228 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GNPATO15228 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GNPATO15228 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GNPATO15228 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GNPATO15228 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GNPATO15228 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GNPATO15228 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GNPATO15228 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GNPATO15228 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GNPATO15228 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GNPATO15228 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GNPATO15228 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GNPATO15228 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GNPATO15228 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GNPATO15228 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GNPATO15228 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GNPATO15228 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GNPATO15228 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GNPATO15228 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GNPATO15228 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GNPATO15228 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GNPATO15228 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GNPATO15228 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GNPATO15228 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GNPATO15228 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GNPATO15228 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GNPATO15228 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GNPATO15228 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GNPATO15228 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GNPATO15228 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GNPATO15228 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GNPATO15228 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms