Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms