Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAPO00193 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAPO00193 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAPO00193 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAPO00193 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAPO00193 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAPO00193 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAPO00193 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAPO00193 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAPO00193 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAPO00193 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAPO00193 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAPO00193 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAPO00193 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAPO00193 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAPO00193 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAPO00193 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAPO00193 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAPO00193 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAPO00193 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAPO00193 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAPO00193 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAPO00193 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAPO00193 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAPO00193 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAPO00193 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAPO00193 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAPO00193 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAPO00193 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAPO00193 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAPO00193 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAPO00193 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAPO00193 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAPO00193 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAPO00193 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAPO00193 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAPO00193 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAPO00193 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAPO00193 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAPO00193 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAPO00193 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAPO00193 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAPO00193 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAPO00193 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAPO00193 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAPO00193 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAPO00193 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAPO00193 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAPO00193 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAPO00193 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAPO00193 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAPO00193 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAPO00193 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAPO00193 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAPO00193 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAPO00193 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAPO00193 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAPO00193 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAPO00193 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAPO00193 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAPO00193 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAPO00193 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAPO00193 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAPO00193 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAPO00193 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAPO00193 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAPO00193 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAPO00193 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAPO00193 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAPO00193 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAPO00193 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAPO00193 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAPO00193 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAPO00193 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAPO00193 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAPO00193 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAPO00193 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMAPO00193 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMAPO00193 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SMAPO00193 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAPO00193 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAPO00193 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAPO00193 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAPO00193 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAPO00193 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAPO00193 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAPO00193 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAPO00193 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAPO00193 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAPO00193 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAPO00193 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAPO00193 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAPO00193 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAPO00193 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAPO00193 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAPO00193 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAPO00193 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAPO00193 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAPO00193 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAPO00193 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms