Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC109597.2-201ENST00000569407 927 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 RN7SL678P-201ENST00000579533 299 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AP001046.1-201ENST00000435702 2816 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 TBC1D3F-201ENST00000620210 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 ZDHHC4-202ENST00000396706 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 HCN3-201ENST00000368358 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
TMPOP42166 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMPOP42166 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMPOP42166 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMPOP42166 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMPOP42166 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMPOP42166 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMPOP42166 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMPOP42166 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMPOP42166 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMPOP42166 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMPOP42166 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMPOP42166 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMPOP42166 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMPOP42166 MDM1-204ENST00000411698 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMPOP42166 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMPOP42166 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMPOP42166 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMPOP42166 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMPOP42166 OR7E37P-201ENST00000421076 897 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMPOP42166 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMPOP42166 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMPOP42166 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMPOP42166 EFHC1-224ENST00000636702 2197 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMPOP42166 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMPOP42166 ACR-201ENST00000216139 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMPOP42166 ITGAL-203ENST00000433423 1416 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMPOP42166 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMPOP42166 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMPOP42166 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMPOP42166 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AC022098.1-201ENST00000588387 2861 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 CREB5-204ENST00000396300 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 DDX11L2-201ENST00000437401 1398 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 TBC1D3I-201ENST00000616671 1982 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 FHL2-208ENST00000409807 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 RNA5SP248-201ENST00000365602 127 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 DTX3L-202ENST00000383661 687 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 ZNF589-202ENST00000412564 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 TULP3P1-202ENST00000453253 1291 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AC104117.1-201ENST00000517817 900 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AC034102.3-201ENST00000551846 300 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AC010601.2-201ENST00000623060 774 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AL592295.4-201ENST00000636161 997 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 MAGED2-205ENST00000375060 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 CAMK2B-202ENST00000346990 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 GLYR1-212ENST00000591451 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms