Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 ZNF542P-207ENST00000495307 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 NOL4L-203ENST00000359676 5991 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 SRRT-216ENST00000618262 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 CARD14-209ENST00000573882 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 PIGG-203ENST00000453061 3218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 SNAI1-201ENST00000244050 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 CDKL2-201ENST00000307465 2565 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 ARMC1-202ENST00000458464 2849 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 ZSCAN20-202ENST00000373413 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 STX16-202ENST00000355957 4897 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 SYS1-201ENST00000243918 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R18-202ENST00000399199 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 TMEM199-201ENST00000292114 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC026304.1-201ENST00000597953 561 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 ZNF839-209ENST00000559185 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 KCTD7-209ENST00000640385 4118 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 NUPL2-201ENST00000258742 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 TMEM174-201ENST00000296776 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 SHOC2-202ENST00000369452 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 HPS1-201ENST00000325103 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 DQX1-201ENST00000393951 2540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHG5-205ENST00000377740 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 ZSCAN5C-202ENST00000534327 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC084855.2-201ENST00000559400 2393 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC134682.1-201ENST00000569285 3377 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 ELOVL1-216ENST00000621943 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 ST5-230ENST00000530438 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 DDR1-238ENST00000446312 3202 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 FLT4-202ENST00000393347 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 NFATC4-209ENST00000553879 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 CLINT1-210ENST00000530742 3344 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 SNAP91-212ENST00000520302 4136 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 ADGRF3-202ENST00000333478 3896 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 KRT17P7-202ENST00000582261 2334 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 OLFML2B-201ENST00000294794 3160 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 SRRM5-201ENST00000417606 2381 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 UGT1A3-201ENST00000482026 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC133919.3-201ENST00000621407 1804 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 DTX3L-202ENST00000383661 687 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 MBP-207ENST00000397865 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms