Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 INO80-211ENST00000616814 4272 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 FAM196A-201ENST00000424811 3149 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AC015818.9-201ENST00000591705 4582 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 SLC36A4-201ENST00000326402 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 FAM86FP-202ENST00000427893 829 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 ELOVL1-216ENST00000621943 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 HSPBAP1-201ENST00000306103 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 RPH3A-202ENST00000415485 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 LILRB3-202ENST00000346401 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 TMEM184B-201ENST00000361684 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AC026797.1-201ENST00000624837 2869 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 FAM160B2-201ENST00000289921 4245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 MAB21L2-201ENST00000317605 2772 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 ASAP3-201ENST00000336689 4050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 LDHA-205ENST00000422447 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 DLEU1-231ENST00000490577 2440 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 TOMM40L-202ENST00000367988 2708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 RSBN1-206ENST00000616024 2703 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AC019294.1-202ENST00000566174 2071 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 ST6GAL1-215ENST00000457772 3947 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 MAGEB1-202ENST00000397548 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 ST3GAL6-202ENST00000394162 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 UCP3-201ENST00000314032 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 RPL13-201ENST00000311528 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 WASF2-202ENST00000618852 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 PTPRD-AS2-201ENST00000429581 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 NDUFAF6-202ENST00000396113 2549 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 CTNNB1-203ENST00000396185 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 NR2F1-AS1-213ENST00000607797 3380 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 INPP5D-204ENST00000445964 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 LDB3-203ENST00000372056 1868 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 NDEL1-203ENST00000402554 1858 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 ZSCAN5C-202ENST00000534327 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 CDC25B-201ENST00000245960 3597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 TNS2-204ENST00000546602 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AGK-201ENST00000355413 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 SFTPA1-203ENST00000428376 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 NR4A3-203ENST00000395097 3794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 ZNF473-205ENST00000595661 4828 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 LRFN3-204ENST00000588831 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 MCPH1-207ENST00000522905 2049 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms