Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 L3MBTL1-202ENST00000373134 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 CCT8-211ENST00000540844 1927 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 MPPE1-204ENST00000344987 1831 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 CNOT4-204ENST00000414802 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 SERPINA1-205ENST00000404814 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC009093.9-201ENST00000566038 1611 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 WASIR2-201ENST00000527434 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 IL32-230ENST00000551122 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC022211.3-201ENST00000584339 400 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC010601.2-201ENST00000623060 774 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 TGM5-207ENST00000622115 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 RABL2B-203ENST00000395591 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 HDGF-203ENST00000368209 2171 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 S100A6-202ENST00000368720 673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC005822.1-201ENST00000414124 1034 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 TULP3P1-202ENST00000453253 1291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK8P49336 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK8P49336 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms