Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRPRBQ9Y5M8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms