Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms