Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SHANK2Q9UPX8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
SHANK2Q9UPX8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SHANK2Q9UPX8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms