Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC8A2Q9UPR5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC8A2Q9UPR5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms