Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULZ9

MMP17, Matrix metalloproteinase-17, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17Q9ULZ9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP17Q9ULZ9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP17Q9ULZ9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms